ミトコンドリアゲノム解析で発見された”隠れた種多様性”―小笠原諸島のリクヒモムシ、広域分布種とは異なる系統を確認―
ミトコンドリアCOX1遺伝子の部分配列（573 bp）に基づく分子系統解析※4の結果、小笠原系統（オレンジ）と、バミューダ諸島・キューバ・マルティニーク島・ニューカレドア・ 沖縄諸島などに分布する広域分布系統（青）は明瞭に分かれ、国内には両系統が分布していることが明らかになった。
（CC BY-NC-ND 4.0に基づき論文より引用し日本語に改変）
【ポイント】
- 小笠原諸島に棲息する紐形動物リクヒモムシは、長らく世界広域分布種と同一視され、以前から小笠原の在来種を捕食する生態系に深刻な影響を与えると考えられてきたが、近年の研究で小笠原の個体群は広域分布種と餌の選好性が異なることが示されていた。
- 本研究では、日本国内に種レベルで異なる2系統のリクヒモムシが分布していることを発見した（図1）。小笠原諸島のリクヒモムシは世界に広く分布する広域分布種とは形態やミトコンドリアゲノム構造が異なる系統であることが分かった。さらに、1980年代の博物館標本の再検討により過去の分布記録も裏づけることができた。
- 本成果は、小型無脊椎動物の中に“隠れた種多様性”が存在することを明らかにしただけなく、島嶼生態系保全におけるDNA情報に基づく種同定・分類の重要性を示した。
【概要】
国立研究開発法人海洋研究開発機構（理事長：大和裕幸、以下「JAMSTEC」）地球環境部門海洋生物環境影響研究センターの波々伯部夏美研究員、昭和医科大学 富士山麓自然・生物研究所の蛭田眞平准教授、東京大学大学院理学系研究科の澤田直人特任研究員、北海道大学大学院 理学研究院の柁原宏教授らの研究チームは、国内に分布するリクヒモムシの正体を明らかにするために形態比較とミトコンドリアゲノムに基づく分子系統解析を行いました。
その結果、日本国内には小笠原系統と広域分布系統という、種レベルで異なる2つのグループが存在することが明らかになりました。小笠原系統は、太平洋〜大西洋の島々に広く分布する広域分布系統（与那国島を含む）とは、ゲノムサイズ・遺伝子配置・形態特徴のいずれにおいても大きく異なっていることが分かりました。
さらに、1980年代に父島で採集され、現在はオランダのナチュラリス生物多様性センターに収蔵されている博物館標本を再調査したところ、現在の小笠原産個体とほぼ同一の特徴をもつことが判明しました。これにより、小笠原には少なくとも半世紀以上前から同じ系統が定着し続けていた可能性が強く示されました。
本研究は、これまで見落とされがちであった小型無脊椎動物の中に“隠れた種多様性”が存在することを明らかにしただけでなく、継続的なフィールド調査と博物館資料の活用を組み合わせた長期的モニタリングが島嶼生態系の保全に重要であることを示しました。
本成果は、2025年12月19日（金）公開のBMC Ecology and Evolutionに掲載されました。
論文名：Unrecognized Species-Level Diversity of Terrestrial Nemerteans in the UNESCO World Heritage Ogasawara Islands Revealed by Mitogenomics
URL：https://doi.org/10.1186/s12862-025-02468-7
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