野生ショウジョウバエを対象とし、DNAの遺伝的変異を指標に、種の系統関係や集団の歴史を探る研究を行っています。
ショウジョウバエ科のハエはこれまでに4000種以上が知られており、極地を除く世界各地に広く分布します。これらの系統関係については古くから注目され、これまで多くの研究が報告されていますが、未だに不明な点が残されています。そこで、ショウジョウバエ科の系統樹の決定版を提出するという目標のもと、海外の研究者とも協力体制を取り、ショウジョウバエの分子系統学的解析を行っています。
また、ショウジョウバエ科は、その食性も、果実食、草本食、あるいはキノコ食と多岐にわたり、さらには野外での行動、季節消長、および微小環境の選好性といった特性も種によって大きく異なります。このような野生ショウジョウバエが持つ形質の多様性に注目し、これらの形質が進化した過程を推定しようと試みています。